Blog Archive
-
2012
(18)
-
Januari(18)
- Linux: BlankOn Sajadah
- Analisa menggunakan HyperChem (Pemodelan Molekul O...
- Manfaat kimia komputasi dalam penemuan Obat
- Avogadro
- Manfaat HyperChem
- Istilah-istilah dalam Kimia Komputasi
- Kimia Komputasi (manfaat untuk pemblajaran dan pen...
- Chemistry animations and movies on the World Wide Web
- Aplikasi kimia yang patut di coba di Linux (http:/...
- Kumpulan Materi dan e-book kimia komputasi
- Kumpulan Link Software kimia free
- ChemDoodle
- ChemOffice
- HYPERCHEM
- JMol
- JChemPaint
- Pengkonversi mol dan massa zat (ChemTool)
- Tabel Periodik Unsur (GElemental)
- 2011 (1)
Blog Archive
-
▼
2012
(18)
-
▼
Januari
(18)
- Linux: BlankOn Sajadah
- Analisa menggunakan HyperChem (Pemodelan Molekul O...
- Manfaat kimia komputasi dalam penemuan Obat
- Avogadro
- Manfaat HyperChem
- Istilah-istilah dalam Kimia Komputasi
- Kimia Komputasi (manfaat untuk pemblajaran dan pen...
- Chemistry animations and movies on the World Wide Web
- Aplikasi kimia yang patut di coba di Linux (http:/...
- Kumpulan Materi dan e-book kimia komputasi
- Kumpulan Link Software kimia free
- ChemDoodle
- ChemOffice
- HYPERCHEM
- JMol
- JChemPaint
- Pengkonversi mol dan massa zat (ChemTool)
- Tabel Periodik Unsur (GElemental)
-
▼
Januari
(18)
About Me

- FeBrizal Ahmad Syah
- Sejatinya, kita tak pernah sungguh - sungguh sendiri, sebab sepi pasti akan menemani.-anonim-
Pengikut
Total Tayangan Halaman
10041
uDankeby. Diberdayakan oleh Blogger.
Rabu, 04 Januari 2012
Analisa menggunakan HyperChem (Pemodelan Molekul Organik)
Pemodelan molekul etana/butana dan konformasinya.
1. Masuk ke program Hyperchem.
2. Menampilkan tabel periodik dari menu Build - Default Elemen.
3. Menggambar molekul etana/butana, kemudian di-model build pada menu Build.
4. Konformasi yang berbeda dari etana/butana diperoleh dengan memvariasi sudut torsi antara empat atom, dilakukan dengan men-set torsi empat atom yang sudah dipilih. Memasukkan sudut (1200) pada set torsion dalam menu Edit dan constrain torsionpada menu Build.
5. Hasil variasi sudut torsi akan memberikan struktur dengan simetri yang berbeda. Untuk etana diperoleh dua struktur yaitu struktur stagger (bersilang) dan struktur eklips. Untuk butana diperoleh empat struktur yaitu struktur anti, struktur gauss, struktur eklips dan struktur metil eklips
1. Masing-masing struktur disimpan sebagai file.hin sendiri, untuk dilakukan kalkulasi energi sistem.
2. Kalkulasi dilakukan dengan metode ab initio, pilih pada menu Setup dengan basis set 6-31G*.
3. Dihitung energinya dengan kalkulasi single point pada menu Compute, untuk optimasi geometri dikalkulasi dengan Geometry Optimization sampai diperoleh konvergensinya.
4. Start log pada menu File dan disimpan sebagai file.log, kemudian dilakukan kalkulasisingle point, setelah konvergensi diperoleh di-stop log.
5. Membuka file.log untuk melihat energi hasil perhitungan dan dibandingkan untuk masing-masing struktur
Catatan : Pemodelan molekul dan konformasinya ini dapat diterapkan juga pada cis-trans sikloheksana dari konromasi kursi sampai konformasi perahu.
Penentuan struktur ortho, meta atau para pada bensen tersubstitusi (Phenol)
1. Masuk program Hyperchem.
2. Lakukan substitusi elektrofilik (CH3+, NO2+, SO3H+) pada posisi ortho, meta dan para. Masing-masing struktur hasil substitusi disimpan sebagai file.hin tersendiri.
3. Lakukan perhitungan menggunakan metode ab initio dengan basis set 6-31G**, baik menggunakan single point atau optimasi geometri.
4. Hasil perhitungan disimpan dalam file.log untuk mengetahui energi, transfer muatan, dan muatan atom.
Source:Harno D Pranowo, Kimia Komputasi, Jurusan Kimia FMIPA UGM, Yogyakarta.
Langganan:
Posting Komentar (Atom)
0 komentar:
Posting Komentar